Учреждение ведет свою историю с 1 апреля 2008 года, когда был создан ГУМО «Центр олимпийской подготовки». В его ведении вошли олимпийские и не олимпийские виды спорта, кроме легкой атлетики и игровых видов.
1 января 2009 года ГУМО «Центр олимпийской подготовки» был переименован в ГУМО «Центр летних видов спорта», который в последствии стал осуществлять специализированную подготовку сборных команд Московской области по летним видам спорта.
27 февраля 2014 года произошло объединение спортивных центров зимних видов спорта и легкой атлетики с ГБУ МО «Центр олимпийских видов спорта». В состав учреждения вошло 38 видов спорта, из них 24 летних и 14 зимних.
9 января 2018 года ГБУ МО «Центр олимпийских видов спорта» был переименован в ГБУ МО «Центр спортивной подготовки по олимпийским видам спорта», такое название оно носит по настоящее время.
На сегодняшний день в Центре числятся спортсмены, представляющие 42 вида спорта, из них 28 летних и 14 зимних.